1999年6月30日下午2时起，暴雨袭击北厍境域，降雨量129毫米，加上下游潮水顶托，上游客水下压，导致外河水位急剧上涨，7月1日凌晨，北厍排涝站测得的外河水位4.37米，超过1954年的水位记录0.13米（1954年的外河水位在当时突破历史记录），镇区内的大小道路全部积水，最深处的积水60厘米。港上村西侧的野鸭荡堤坝决口，威胁东片、南片包围内的村庄、农田的安全，梅墩、大义、大港上等村的部分农田被淹，吴江市委书记汝留根闻讯后，亲临现场指挥抗洪排涝。吴江市人民政府吁请中国人民解放军驻吴江部队官兵200多人协同北厍镇的干部群众投入抢险救灾运动。

是夜（6月30日），市、镇领导和解放军官兵、干部群众，根据险情和地理环境，连夜堆筑沿野鸭荡周边到黎星村的十里长堤临时大坝。

张家港排涝站日夜不间断开机排涝；水位降低后，北厍镇的农技人员深入一线指导灾后生产，部份农田改为直播稻，终于将洪涝灾害造成的损失减少到最低程度，是年，全镇水稻平均亩产515.4千克。